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Investigation
Hepatitis C and other RNA virus
Research Lines
Content with Investigacion .
Hepatitis
- Diseño de métodos diagnósticos para el estudio de los virus de las hepatitis (VH) A, B, C, D, E: Diseñamos sistemas de PCR para su detección y caracterización.
- Evaluación de métodos diagnósticos de los VH. Colaboramos con empresas para estudios de sensibilidad y especificidad de equipos diagnósticos.
- Estudios de Seroprevalencia de los virus de las hepatitis.
- Epidemiología genómica de genomas completos de VHA, VHB, VHC, VHD y VHE en colaboración con el ECDC. Estudios de trazabilidad del VHE.
- Caracterización molecular de virus de las hepatitis mediante secuenciación masiva: a) VHB: mutantes de escape HBsAg (prevalencia y efectos en la detección del HBsAg). Estudio de mutaciones en epítopos de estimulación inmune y mutaciones asociadas a evolución clínica desfavorable.
- b) VHC: resistencias a los antivirales de acción directa. Análisis molecular de subtipos poco frecuentes.
c) Estudios filogenéticos del VHD.
d) Análisis genómico del VHE.
e) Investigación etiológica de hepatitis no filiadas mediante estudios de metagenómica.
- b) VHC: resistencias a los antivirales de acción directa. Análisis molecular de subtipos poco frecuentes.
Research projects
Content with Investigacion .
1. Proyecto CIBEREPS 2022. Microbiological and genomic investigation of hepatitis in children by metagenomic approach in case and control subjects (IP: Ana Avellón).
2023-2024. En colaboración con el Hospital San Joan de Deu de Barcelona.
2. MPY 501-19: Tracking hepatitis E virus infection by means of epidemiological research and whole genome sequencing. Project TrazHE. (IP: Ana Avellón). 2020-2024.
3. Proyecto CIBEREPS 2021 Metagenomic sequencing to identify viral aetiologies in undiagnosed paediatric cases of meningitis and encephalitis (IP: D. Tarragó). 2021-2022.
4. MPY 383/19 (PEJ2018-004446-A). Ayudas para la promoción de empleo joven e implantación de la garantía juvenil en I+D+I. análisis de la complejidad de secuencias de los virus de la hepatitis A, B, C; D y E (VHA, VHB, VHC, VHD y VHE) mediante técnicas de secuenciación masiva. (IP: Ana Avellón). 2020-2021.
5. MPY 1285/16 Movilidad "Salvador de Madariaga" programa estatal de promoción de talento y su empleabilidad. (IP: Ana Avellón). 2016.
Publications
COVID-19 Associated Pulmonary Aspergillosis (CAPA): Hospital or Home Environment as a source of life-threatening Aspergillus fumigatus infection?
Peláez-García de la Rasilla T, González-Jiménez I, García-Fernández Arroyo A, Roldán A, Carretero-Ares JL, Clemente-García M,, Martínez-Suarez M, Vázquez Valdés F, Melón-Garcia S, Mellado E, Sánchez-Nuñez ML on behalf HUCAPA group. Journal of Fungi, 2022 Mar 19;8(3):316.
PUBMED DOIEpidemiology and susceptibility to antimicrobial agents of the main Nocardia species in Spain.
Valdezate S, Garrido N, Carrasco G, Medina-Pascual MJ, Villalón P, Navarro AM, Saéz-Nieto JA. Epidemiology and susceptibility to antimicrobial agents of the main Nocardia species in Spain. J Antimicrob Chemother. 2017;72(3):754-761.
PUBMED DOIRevisiting the Ancylostoma caninum secretome provides new information on hookworm-host interactions.
Morante T, Shepherd C, Constantinoiu C, Loukas A, Sotillo J. Revisiting the Ancylostoma caninum secretome provides new information on hookworm-host interactions. Proteomics. 2017 Dec;17(23-24).
PUBMED DOI