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Investigation

Transcriptomic tools applied to the diagnosis and prognosis of infectious diseases

Research Lines

Content with Investigacion Nuevos antifúngicos y aspergilosis crónicas .

Nuevos antifúngicos y aspergilosis crónicas.

Epidemiología, resistencia y actividad de nuevos antifúngicos

El conocimiento de la epidemiología y la tasa de resistencia a los antifúngicos es esencial para un manejo adecuado de los pacientes y una estrategia de detección y diagnostico apropiada. La resistencia a los antimicrobianos es hoy una de las mayores amenazas para la salud mundial siendo el desarrollo y comercialización de nuevos compuestos una de las prioridades del sector de la salud. Se han realizado en colaboración con centros del Sistema Nacional de Salud varios estudios poblacionales, con el fin de conocer la epidemiología de los hongos filamentosos en España y la tasa de resistencia a los antifúngicos. Se ha encontrado que más de un 10% de las infecciones por hongos filamentosos están producidas por especies crípticas que suelen ser más resistentes a los antifúngicos. En los últimos años han aparecido varios compuestos con capacidad antifúngica que están en diferentes fases de desarrollo, en nuestro grupo se ensayan estos nuevos compuestos frente a los principales géneros de especies patógenas, incluyendo las especies crípticas multiresistentes. 

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Aspergilosis Pulmonar Crónica y Aspergilosis Broncopulmonar alérgica

Estas enfermedades ocurren generalmente en personas inmunocompetentes. La incidencia de estas enfermedades es prácticamente desconocida. La ausencia de un diagnóstico apropiado y del tratamiento óptimo complica el manejo de estos pacientes. Varios estudios han documentado la presencia de cepas multiresistentes en estos pacientes, debido a tratamiento prolongados. En esta línea se está trabajando en mejorar el algoritmo diagnóstico de estas enfermedades, así como analizar la epidemiología de las especies aisladas en estas infecciones y la influencia de cambios en el micobioma pulmonar y ambiental.
 

Enfermedades fúngicas y Salud global

Muchos países de renta media y baja se encuentran en zonas de alta incidencia de hongos, sin embargo, tienen menos herramientas y capacidad diagnóstica para manejarlas. Con el fin de conocer la incidencia de las infecciones oportunistas por hongos y disminuir la muerte asociada a las mismas en pacientes que viven con VIH en Guatemala y en colaboración con el Fondo de acción Global para las infecciones fúngicas (GAFFI), se ha desarrollado una red de unidades de atención integral al sida e implementado un laboratorio central de diagnóstico, que hace de referencia para el diagnóstico en varias infecciones oportunistas. Se ha hecho un estudio de cohortes incluyendo a más de 2500 pacientes HIV+ con un seguimiento de un año. Se han tamizado las principales infecciones fúngicas en este grupo de pacientes permitiendo el acceso al diagnóstico y al tratamiento de las mismas en la mayor parte del país y consiguiendo una disminución de mortalidad en un año del 7%.

Research projects

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​1.    Relación ambiente-micobioma en pacientes con asma grave. Implicación en el desarrollo de enfermedad y estudio de posibles medidas de prevención hacia la medicina personalizada. Fondo de Investigaciones Sanitarias. IP: Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2021-2023
2.    MixInYest: a multicenter survey on mixed yeast infections in Europe. ESCMID IP: Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2018-2021
3.    Micobioma de muestras respiratorias: desarrollo de base de datos de comparación, estandarización, caracterización y estudio de su influencia en la evolución de enfermedad. Fondo de Investigaciones Sanitarias IP: Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2017-2021
4.    Minimising HIV deaths through rapid fungal diagnosis and better care in Guatemala. Funding Global Action Fund for Fungal Infections and JYLAG. IP: Ana Alastruey-Izquierdo and Juan Luis Rodríguez-Tudela. Fechas: 2015-2020
5.    CPAepi: CPAepi: Epidemiology of Aspergillus strains isolated from patients suffering of CPA. European Confederation of Medical Mycology (ECMM). IP: Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2019-2020
6.    In vitro activity of SCY-078 and comparators against clinical isolates of Aspergillus spp. Scynexis. IP: Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2018-2019
7.    In vitro activity of F901318 and comparators against clinical isolates of clinical isolates of Scedosporium and Lomentospora. F2G LTD. IP: Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2017-2018
8.    In vitro activity of F901318 and comparators against clinical isolates of clinical isolates of cryptic species of Aspergillus. Funding: F2G LTD. IP: Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2016-2017
9.    In vitro activity of APX001A and comparators against clinical isolates of clinical isolates of rare moulds. Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2016-2017
10.    Population-Based Prospective Surveillance on Triazole Resistance in Aspergillus and other moulds in Spain (FILPOP_2 study). GILEAD Sciences. Ana Alastruey-Izquierdo and Manuel Cuenca Estrella. Fechas: 2015-2017
11.    Estudio epidemiológico de las resistencias a los antifúngicos mediante secuenciación genómica y análisis bioinformático para el diseño de técnicas diagnosticas útiles en laboratorios clínicos (2014-2017). Fondo de Investigaciones Sanitarias Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2014-2017

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Serum galactomannan-based early detection of invasive aspergillosis in hematology patients receiving effective antimold prophylaxis

8: Duarte RF, Sánchez-Ortega I, Cuesta I, Arnan M, Patiño B, Fernández de Sevilla A, Gudiol C, Ayats J, Cuenca-Estrella M. Serum galactomannan-based early detection of invasive aspergillosis in hematology patients receiving effective antimold prophylaxis. Clin Infect Dis. 2014 Dec 15;59(12):1696-702.

PUBMED DOI

Analysis of the protein domain and domain architecture content in fungi and its application in the search of new antifungal targets.

9: Barrera A, Alastruey-Izquierdo A, Martín MJ, Cuesta I, Vizcaíno JA. Analysis of the protein domain and domain architecture content in fungi and its application in the search of new antifungal targets. PLoS Comput Biol. 2014 Jul 17;10(7):e1003733.

PUBMED DOI

Cryptococcus neoformans can form titan-like cells in vitro in response to multiple signals

2. Trevijano-Contador N, de Oliveira HC, García-Rodas R, Rossi SA, Llorente I, Zaballos Á, Janbon G, Ariño J, Zaragoza Ó. Cryptococcus neoformans can form titan-like cells in vitro in response to multiple signals. PLoS Pathog. 2018 May 18;14(5):e1007007.

PUBMED DOI

Reclassification of the Candida haemulonii complex as Candida haemulonii (C. haemulonii group I), C. duobushaemulonii sp. nov. (C. haemulonii group II), and C. haemulonii var. vulnera var. nov.: three multiresistant human pathogenic yeasts

4. Cendejas-Bueno E, Kolecka A, Alastruey-Izquierdo A, Theelen B, Groenewald M, Kostrzewa M, Cuenca-Estrella M, Gómez-López A, Boekhout T. Reclassification of the Candida haemulonii complex as Candida haemulonii (C. haemulonii group I), C. duobushaemulonii sp. nov. (C. haemulonii group II), and C. haemulonii var. vulnera var. nov.: three multiresistant human pathogenic yeasts. J Clin Microbiol.

PUBMED DOI

Molecular Identification and Susceptibility Testing of Molds Isolated in a Prospective Surveillance of Triazole Resistance in Spain (FILPOP2 Study).

5. Alastruey-Izquierdo A, Alcazar-Fuoli L, Rivero-Menéndez O, Ayats J, Castro C, García-Rodríguez J, Goterris-Bonet L, Ibáñez-Martínez E, Linares-Sicilia MJ, Martin-Gomez MT, Martín-Mazuelos E, Pelaez T, Peman J, Rezusta A, Rojo S, Tejero R, Anza DV, Viñuelas J, Zapico MS, Cuenca-Estrella M; the FILPOP2 Project from GEMICOMED (SEIMC) and REIPI. Molecular Identification and Susceptibility Testing of Molds Isolated in a Prospective Surveillance of Triazole Resistance in Spain (FILPOP2 Study). Antimicrob Agents Chemother. 2018 Aug 27;62(9).

PUBMED DOI

Evaluation of Bronchoalveolar Lavage Fluid Cytokines as Biomarkers for Invasive Pulmonary Aspergillosis in At-Risk Patients

6. Gonçalves SM, Lagrou K, Rodrigues CS, Campos CF, Bernal-Martínez L, Rodrigues F, Silvestre R, Alcazar-Fuoli L, Maertens JA, Cunha C, Carvalho A. Evaluation of Bronchoalveolar Lavage Fluid Cytokines as Biomarkers for Invasive Pulmonary Aspergillosis in At-Risk Patients. Front Microbiol. 2017 Nov 29;8:2362.

PUBMED DOI

Polymorphisms in Host Immunity-Modulating Genes and Risk of Invasive Aspergillosis: Results from the AspBIOmics Consortium

7. Lupiañez CB, Canet LM, Carvalho A, Alcazar-Fuoli L, Springer J, Lackner M, Segura-Catena J, Comino A, Olmedo C, Ríos R, Fernández-Montoya A, Cuenca-Estrella M, Solano C, López-Nevot MÁ, Cunha C, Oliveira-Coelho A, Villaescusa T, Fianchi L, Aguado JM, Pagano L, López-Fernández E, Potenza L, Luppi M, Lass-Flörl C, Loeffler J, Einsele H, Vazquez L; PCRAGA Study Group, Jurado M, Sainz J. Polymorphisms in Host Immunity-Modulating Genes and Risk of Invasive Aspergillosis: Results from the AspBIOmics Consortium. Infect Immun. 2015 Dec 14;84(3):643-57.

PUBMED DOI

Cell Wall Changes in Amphotericin B-Resistant Strains from Candida tropicalis and Relationship with the Immune Responses Elicited by the Host.

9. Mesa-Arango AC, Rueda C, Román E, Quintin J, Terrón MC, Luque D, Netea MG, Pla J and Zaragoza O. Cell Wall Changes in Amphotericin B-Resistant Strains from Candida tropicalis and Relationship with the Immune Responses Elicited by the Host. Antimicrob. Agents Chemother. 2016. 60(4):2326-35.

PUBMED DOI

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