Transcriptomic tools applied to the diagnosis and prognosis of infectious diseases
Research Lines
Content with Investigacion .
Nuevos antifúngicos y aspergilosis crónicas.
Epidemiología, resistencia y actividad de nuevos antifúngicos
El conocimiento de la epidemiología y la tasa de resistencia a los antifúngicos es esencial para un manejo adecuado de los pacientes y una estrategia de detección y diagnostico apropiada. La resistencia a los antimicrobianos es hoy una de las mayores amenazas para la salud mundial siendo el desarrollo y comercialización de nuevos compuestos una de las prioridades del sector de la salud. Se han realizado en colaboración con centros del Sistema Nacional de Salud varios estudios poblacionales, con el fin de conocer la epidemiología de los hongos filamentosos en España y la tasa de resistencia a los antifúngicos. Se ha encontrado que más de un 10% de las infecciones por hongos filamentosos están producidas por especies crípticas que suelen ser más resistentes a los antifúngicos. En los últimos años han aparecido varios compuestos con capacidad antifúngica que están en diferentes fases de desarrollo, en nuestro grupo se ensayan estos nuevos compuestos frente a los principales géneros de especies patógenas, incluyendo las especies crípticas multiresistentes.
Aspergilosis Pulmonar Crónica y Aspergilosis Broncopulmonar alérgica
Estas enfermedades ocurren generalmente en personas inmunocompetentes. La incidencia de estas enfermedades es prácticamente desconocida. La ausencia de un diagnóstico apropiado y del tratamiento óptimo complica el manejo de estos pacientes. Varios estudios han documentado la presencia de cepas multiresistentes en estos pacientes, debido a tratamiento prolongados. En esta línea se está trabajando en mejorar el algoritmo diagnóstico de estas enfermedades, así como analizar la epidemiología de las especies aisladas en estas infecciones y la influencia de cambios en el micobioma pulmonar y ambiental.
Enfermedades fúngicas y Salud global
Muchos países de renta media y baja se encuentran en zonas de alta incidencia de hongos, sin embargo, tienen menos herramientas y capacidad diagnóstica para manejarlas. Con el fin de conocer la incidencia de las infecciones oportunistas por hongos y disminuir la muerte asociada a las mismas en pacientes que viven con VIH en Guatemala y en colaboración con el Fondo de acción Global para las infecciones fúngicas (GAFFI), se ha desarrollado una red de unidades de atención integral al sida e implementado un laboratorio central de diagnóstico, que hace de referencia para el diagnóstico en varias infecciones oportunistas. Se ha hecho un estudio de cohortes incluyendo a más de 2500 pacientes HIV+ con un seguimiento de un año. Se han tamizado las principales infecciones fúngicas en este grupo de pacientes permitiendo el acceso al diagnóstico y al tratamiento de las mismas en la mayor parte del país y consiguiendo una disminución de mortalidad en un año del 7%.
Research projects
Content with Investigacion .
1. Relación ambiente-micobioma en pacientes con asma grave. Implicación en el desarrollo de enfermedad y estudio de posibles medidas de prevención hacia la medicina personalizada. Fondo de Investigaciones Sanitarias. IP: Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2021-2023
2. MixInYest: a multicenter survey on mixed yeast infections in Europe. ESCMID IP: Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2018-2021
3. Micobioma de muestras respiratorias: desarrollo de base de datos de comparación, estandarización, caracterización y estudio de su influencia en la evolución de enfermedad. Fondo de Investigaciones Sanitarias IP: Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2017-2021
4. Minimising HIV deaths through rapid fungal diagnosis and better care in Guatemala. Funding Global Action Fund for Fungal Infections and JYLAG. IP: Ana Alastruey-Izquierdo and Juan Luis Rodríguez-Tudela. Fechas: 2015-2020
5. CPAepi: CPAepi: Epidemiology of Aspergillus strains isolated from patients suffering of CPA. European Confederation of Medical Mycology (ECMM). IP: Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2019-2020
6. In vitro activity of SCY-078 and comparators against clinical isolates of Aspergillus spp. Scynexis. IP: Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2018-2019
7. In vitro activity of F901318 and comparators against clinical isolates of clinical isolates of Scedosporium and Lomentospora. F2G LTD. IP: Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2017-2018
8. In vitro activity of F901318 and comparators against clinical isolates of clinical isolates of cryptic species of Aspergillus. Funding: F2G LTD. IP: Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2016-2017
9. In vitro activity of APX001A and comparators against clinical isolates of clinical isolates of rare moulds. Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2016-2017
10. Population-Based Prospective Surveillance on Triazole Resistance in Aspergillus and other moulds in Spain (FILPOP_2 study). GILEAD Sciences. Ana Alastruey-Izquierdo and Manuel Cuenca Estrella. Fechas: 2015-2017
11. Estudio epidemiológico de las resistencias a los antifúngicos mediante secuenciación genómica y análisis bioinformático para el diseño de técnicas diagnosticas útiles en laboratorios clínicos (2014-2017). Fondo de Investigaciones Sanitarias Ana Alastruey-Izquierdo. Fechas: 2014-2017
Publications
Frecuencia de sustituciones relevantes asociadas a resistencia en la región NS5A a elbasvir en el virus de la hepatitis C en pacientes con genotipo 1a en España
2. Palladino C, Esteban-Cartelle B, Mate-Cano I, Sánchez-Carrillo M, Resino S, Briz V. Frecuencia de sustituciones relevantes asociadas a resistencia en la región NS5A a elbasvir en el virus de la hepatitis C en pacientes con genotipo 1a en España Enferm Infecc Microbiol Clin. 2018; 36 (5): 262-267. (A; FI= 1.707; Q2 Microbiology).
PUBMED DOIDevelopment of water-soluble polyanionic carbosilane dendrimers as novel and highly potent topical anti-HIV-2 microbicides.
4. Briz V, Sepulveda-Crespo D, Diniz AR; Borrego P, Rodes B; Javier de la Mata F, Gomez R, Taveira N, Muñoz-Fernandez MA. Development of water-soluble polyanionic carbosilane dendrimers as novel and highly potent topical anti-HIV-2 microbicides. Nanoscale 2015, 7(35): 14669-14683. (A; FI= 7.76; D1 Materials Science, Multidisciplinary).
PUBMED DOIHepatitis A outbreak disproportionately affecting men who have sex with men (MSM) in the European Union and European Economic Area, June 2016 to May 2017.
6. Hepatitis A outbreak disproportionately affecting men who have sex with men (MSM) in the European Union and European Economic Area, June 2016 to May 2017. Ndumbi P, Freidl GS, Williams CJ, Mårdh O, Varela C, Avellón A, …. Severi E; Members Of The European Hepatitis A Outbreak Investigation Team. Euro Surveill. 2018 Aug;23(33). doi: 10.2807/1560-7917.ES.2018.23.33.1700641.
PUBMED DOIDetection of hepatitis C virus (HCV) core-specific antibody suggests occult HCV infection among blood donors
7. Detection of hepatitis C virus (HCV) core-specific antibody suggests occult HCV infection among blood donors. Quiroga JA, Avellón A, Bartolomé J, Andréu M, Flores E, González MI, González R, Pérez S, Richart LA, Castillo I, Alcover J, Palacios R, Carreño V, Echevarría JM. Transfusion. 2016 Jul;56(7):1883-90. Epub 2016 May 17.
PUBMED DOIHepatitis E virus: Assessment of the epidemiological situation in humans in Europe, 2014/15.
8. Hepatitis E virus: Assessment of the epidemiological situation in humans in Europe, 2014/15. Adlhoch C, Avellon A, Baylis SA, Ciccaglione AR, Couturier E, de Sousa R, Epštein J, Ethelberg S, Faber M, Fehér Á, Ijaz S, Lange H, Manďáková Z, Mellou K, Mozalevskis A, Rimhanen-Finne R, Rizzi V, Said B, Sundqvist L, Thornton L, Tosti ME, van Pelt W, Aspinall E, Domanovic D, Severi E, Takkinen J, Dalton HR. J Clin Virol. 2016 Sep;82:9-16. Epub 2016 Jun 23.
PUBMED DOIFull coding hepatitis E virus genotype 3 genome amplification method
9. Full coding hepatitis E virus genotype 3 genome amplification method. Muñoz-Chimeno M, Forero JE, Echevarría JM, Muñoz-Bellido JL, Vázquez-López L, Morago L, García-Galera MC, Avellón A. J Virol Methods. 2016 Apr;230:18-23. Epub 2016 Jan 16.
PUBMED DOIAntigenicity of Leishmania-Activated C-Kinase Antigen (LACK) in Human Peripheral Blood Mononuclear Cells, and Protective Effect of Prime-Boost Vaccination With pCI-neo-LACK Plus Attenuated LACK-Expressing Vaccinia Viruses in Hamsters
2. Fernández L, Carrillo E, Sánchez-Sampedro L, Sánchez C, Ibarra-Meneses AV, Jimenez MA, Almeida VDA, Esteban M, Moreno J. Antigenicity of Leishmania-Activated C-Kinase Antigen (LACK) in Human Peripheral Blood Mononuclear Cells, and Protective Effect of Prime-Boost Vaccination With pCI-neo-LACK Plus Attenuated LACK-Expressing Vaccinia Viruses in Hamsters. Front Immunol. 2018 Apr 23;9:843.
PUBMED DOIInterleukin-2 as a marker for detecting asymptomatic individuals in areas where Leishmania infantum is endemic.
5. Ibarra-Meneses AV, Carrillo E, Sánchez C, García-Martínez J, López Lacomba D, San Martin JV, Alves F, Alvar J, Moreno J. Interleukin-2 as a marker for detecting asymptomatic individuals in areas where Leishmania infantum is endemic. Clin Microbiol Infect. 2016 Aug;22(8):739.e1-4.
PUBMED DOIContent with Investigacion .
-

Ana Alastruey Izquierdo
Research Scientist
ORCID code: 0000-0001-8651-4405
Doctor in microbiology from the Complutense University of Madrid and Master in Bioinformatics and computational biology from the same university. He completed his doctoral thesis at the ISCIII under the supervision of Dr. Juan Luis Rodríguez Tudela in molecular identification of human pathogenic fungi. He carried out research stays in Holland (Fungal Biodiversity Center, CBS-Knaw, Utrecht) and Austria (Austrian Institute of Technology). In 2010-2011 he joined Dr. David Perlin's group as a postdoctoral fellow at the Public Health Research Institute of Rutgers University in the United States working on antifungal resistance. In 2012 and 2013 he carried out research stays at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI). Since 2014 he has been a Senior Scientist at the ISCIII.
-
Laura Alguacil Cuéllar
PhD student (pFIS)
ORCID code: 0000-0002-7362-0214
Graduated in Biology from the Rey Juan Carlos University, she completed the Master's Degree in Microbiology and Parasitology: Research and Development from the Complutense University of Madrid (UCM) and is an expert in Research Methodology and Evidence-Based Clinical Practice from the Miguel de Cervantes European University. For two years he was a research assistant in the Microbiology department of the Faculty of Pharmacy at the UCM thanks to a CM Young Employment Scholarship. In 2023 he joined ISCIII with a pFIS predoctoral contract under the direction of Dr. Ana Alastruey Izquierdo.
List of staff