We protect your health through science
Investigation
Microbial Immunology and Immunogenetics
Research Lines
Content with Investigacion .
Neisseria, Listeria y Bordetella
• Invasive Meningococcal Disease.
o Laboratory surveillance based on whole-genome sequencing and its application in Public Health.
o Study and characterization of antimicrobial resistance mechanisms.
o Study and evaluation of conventional (polysaccharide) and new-generation (protein) vaccines.
• Gonococcal Infection (Gonorrhea).
o Laboratory surveillance based on whole-genome sequencing and its application in Public Health.
o Study and characterization of antimicrobial resistance mechanisms.
• Listeriosis.
o Laboratory surveillance based on whole-genome sequencing and its application in Public Health.
• Pertussis.
o Development and application of molecular techniques for the diagnosis and characterization of Bordetella pertussis, B. parapertussis, B. holmessi, and B. bronchiseptica.
Research projects
Content with Investigacion .
1. Project Title: Determination of the degree of identity of common antigens of N. meningitidis and N. gonorrhoeae using genomic and immunological tools.
Principal Investigator: Raquel Abad Torreblanca
Funding Entity: ISCIII. Program: Strategic Action in Intramural Health
Reference: PI23CIII/00040
Period: 2024-2026
Amount Awarded: €68,500
2. Project Title: Meningococcal Disease and Molecular Epidemiology (MEMORY).
Principal Investigator: Raquel Abad Torreblanca and Julio A. Vázquez Moreno
Funding Entity: Pfizer Inc.
Reference: MVP 352/21
Period: 2022-2024
Amount Awarded: €82,834.50
3. Project Title: Modelling Approaches to Guide Intelligent Surveillance for the Sustainable Introduction of Novel Antibiotics. MAGIcIAN.
Principal Investigator: Raquel Abad Torreblanca
Funding Entity: ISCIII / International Joint Action / Joint Programming Initiatives (JPI) Program
Reference: AC19CIII/00002
Period: 2020-2024
Amount Awarded: €46,000
4. Project Title: Epidemiological, Microbiological, and Clinical Analysis of the Listeriosis Outbreak in Andalusia. LISMOAN Study.
Principal Investigator: José Miguel Cisneros Herreros
Funding Entity: FISEVI (Andalusian Public Foundation for Health Research Management)/FPS2020 Call for Proposals
Reference: PI-0001-2020
Period: 2020-2023
Amount Awarded: €114,954
5. Project Title: Population Structure of Neisseria meningitidis Using Massive Sequencing: A Potential Tool for Estimating Vaccine Effectiveness?
Principal Investigator: Raquel Abad Torreblanca
Funding Entity: ISCIII / Strategic Action in Intramural Health
Reference: PI19CIII/00030
Period: 2020-2023
Amount Awarded: €67,153
6. Project Title: Management agreement between the Ministry of Health, Social Services and Equality (Directorate General of Public Health, Quality and Innovation) and the Carlos III Health Institute, for the laboratory determinations corresponding to the 2nd seroprevalence study in Spain.
Principal Investigator: Fernando de Ory and Julio A. Vázquez
Funding Entity: Directorate General of Public Health, Ministry of Health
Reference: MEG151/17
Period: 2018-2020
Amount Awarded: €565,663
7. Project Title: Effectiveness of the Meningococcal B Vaccine in Immunocompromised Children with Sickle Cell Disease
Principal Investigator: Raquel Abad Torreblanca
Funding Entity: Spanish Society of Pediatric Hematology and Oncology Foundation (SEHOP)
Reference: MVP 199/18
Period: 2018-2020
Amount Awarded: €18,285
8. Project Title: Application of Massive Sequencing and Immunological Approaches in the Expression Analysis of New Vaccine Antigens in Meningococcal Populations
Principal Investigator: Raquel Abad Torreblanca
Funding Entity: ISCIII / Strategic Action in Intramural Health
Reference: PI16CIII/00023
Period: 2017-2020
Amount Awarded: €115,084
9. Project Title: fHbp variability over time and potential coverage of the new meningococcal serogroup B vaccine (bivalent rLP2086/fHbp) in Spain.
Principal Investigators: Raquel Abad and Julio A. Vázquez
Funding Entity: Pfizer SLU
Reference: MVP 1273/16
Period: 2017-2020
Amount Awarded: €125,350
10. Project Title: Estimation of protection of a conjugate vaccine against meningococcus serogroup C based on a mathematical model.
Principal Investigator: Julio A. Vázquez and Javier Díez
Funding Entity: Higher Center for Research in Public Health (CSISP)
Reference: MVP 1116/11
Period: 2011-2017
Amount awarded: €143,750
Publications
Ribavirin Had Demonstrable Effects on the Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Virus (CCHFV) Population and Load in a Patient With CCHF Infection
9. Nicole Espy; Unai Pérez-Sautu; Eva Ramírez de Arellano; Anabel Negredo; MR Wiley; S Bavari; Marta Díaz Manéndez; María Paz Sánchez-Seco; Gustavo Palacios. Ribavirin Had Demonstrable Effects on the Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Virus (CCHFV) Population and Load in a Patient With CCHF Infection. J Infect Dis. 217 - 12, pp. 1952 - 1956. 25/05/2018.
PUBMED DOIAcute respiratory distress syndrome after convalescent plasma use: treatment of a patient with Ebola virus disease contracted in Madrid, Spain.
10. M Mora-Rillo, M Arsuaga, G Ramírez-Olivencia, F de la Calle, A M Borobia, P Sánchez-Seco, M Lago, J C Figueira, B Fernández-Puntero, A Viejo, A Negredo, C Nuñez, E Flores, A J Carcas, V Jiménez-Yuste, F Lasala, A García-de-Lorenzo, F Arnalich, J R Arribas, for the La Paz-Carlos III University Hospital Isolation Unit. Acute respiratory distress syndrome after convalescent plasma use: treatment of a patient with Ebola virus disease contracted in Madrid, Spain. Lancet Respir Med. 3-7, pp:554-562. 31/05/2015
PUBMED DOIViral infections of the central nervous system in Spain: a prospective study.
1. F. de Ory, A. Avellón, J.E. Echevarría, M.P. Sánchez-Seco, G. Trallero, M. Cabrerizo, I. Casas, F. Pozo, G. Fedele, D. Vicente, M. J. Pena, A. Moreno, J. Niubo, N. Rabella, G. Rubio, M. Pérez Ruiz, M. Rodríguez-Iglesias, C. Gimeno, J.M. Eiros, S. Melón, M. Blasco, I. López-Miragaya, E. Varela, A. Martinez-Sapiña, G. Rodríguez, M.Á. Marcos, M.I. Gegúndez, G. Cilla, I. Gabilondo, J.M. Navarro, J. Torres, C. Aznar, A. Castellanos, M.E. Guisasola, A.I. Negredo, A. Tenorio, S. Vázquez-Morón (2013). Viral Infections of the Central Nervous System in Spain: a prospective Study. JOURNAL OF MEDICAL VIROLOGY 85: 554-562.
PUBMED DOIFirst case of imported Zika virus infection in Spain
4. P. Bachiller-Luque, M. Dominguez-Gil-González, J. Alvarez-Manzanares, A. Vázquez, F. de Ory, M.P. Sánchez-Seco Fariñas (2016). First case of Zika virus infection imported to Spain (original breve). ENFERMEDADES INFECCIOSAS Y MICROBIOLOGÍA CLÍNICA, 34: 243-246.
PUBMED DOIChikungunya virus infections among travellers returning to Spain, 2008 to 2014.
5. M.D. Fernandez-Garcia, M. Bangert, F. de Ory, A. Potente, L. Hernández, F. Lasala, L. Herrero, F. Molero, A. Negredo, A. Vázquez, T. Minguito, P. Balfagón, J. de la Fuente, S. Puente, E. Ramírez de Arellano, M. Lago, M.J. Martinez, J. Gascón, F. Norman, R. Lopez-Velez, E. Sulleiro, D. Pou, N. Serre, R. Fernández-Roblas, A. Tenorio, L. Franco, M.P. Sánchez-Seco (2016). Chikungunya virus infections among travelers returning to Spain, 2008-2014. EUROSURVEILLANCE 2016; 21(36):pii=30336.
PUBMED DOIComparison of commercial methods of immunoblot, ELISA, and chemiluminescent immunoassay for detecting type-specific herpes simplex viruses-1 and -2 IgG.
7. F. de Ory, M.E. Guisasola, P. Balfagón, J.C. Sanz. 2018. Comparison of commercial methods of immunoblot, ELISA, and chemiluminescent immunoassay for detecting type-specific herpes simplex viruses-1 and -2 IgG. JOURNAL OF CLINICAL LABORATORY ANALYSIS; 32:e22203.
PUBMED DOIGenomic non-coding regions reveal hidden patterns of mumps virus circulation in Spain, 2005 to 2015.
8. A.M. Gavilán, A. Fernández-García, A. Rueda, A. Castellanos, J. Masa-Calles, N. López-Perea, M.V. Torres de Mier, F. de Ory, J.E. Echevarría. 2018. Genomic non-coding regions reveal hidden patterns of mumps virus circulation in Spain, 2005 to 2015. EUROSURVEILLANCE, 2018;23(15):pii=17-00349.
PUBMED DOIComparative evaluation of indirect immunofluoresecence and NS-1 based ELISA for the determination of Zika virus specific IgM.
9. F. de Ory, M.P. Sánchez-Seco, A. Vázquez, M.D. Montero, E. Sulleiro, M.J. Martinez, L. Matas, F.J. Merino, and Working Group for the Study of Zika Virus Infections (WGSZVI). 2018. Comparative evaluation of indirect immunofluoresecence and NS-1 based ELISA for the determination of Zika virus specific IgM. VIRUSES 10, 379
PUBMED DOIMeasles virus genotype D4 strains with non-standard genome lengths circulated during the large outbreaks in Spain in 2011-2012
10. H. Gil, A. Fernández-García, M.M. Mosquera, J.M. Hübschen, A. Castellanos, F. de Ory, J. Masa, J.E. Echevarria. 2018. Measles virus genotype D4 strains with non-standard length M-F non-coding region circulated during the major outbreaks of 2011-2012 in Spain. PLOS ONE July 16, 2018.
PUBMED DOIHepatitis E genotype 3 genome: A comprehensive analysis of entropy, motif conservation, relevant mutations, and clade-associated polymorphisms
• Muñoz-Chimeno M, Rodríguez-Paredes V, García-Lugo MA, Avellón A. Hepatitis E genotype 3 genome: A comprehensive analysis of entropy, motif conservation, relevant mutations, and clade-associated polymorphisms. Front Microbiol. 2022 Oct 6;13:1011662.
PUBMED DOIFrecuencia de sustituciones relevantes asociadas a resistencia en la región NS5A a elbasvir en el virus de la hepatitis C en pacientes con genotipo 1a en España
Palladino C, Esteban-Cartelle B, Mate-Cano I, Sánchez-Carrillo M, Resino S, Briz V. Frecuencia de sustituciones relevantes asociadas a resistencia en la región NS5A a elbasvir en el virus de la hepatitis C en pacientes con genotipo 1a en España Enferm Infecc Microbiol Clin. 2018; 36 (5): 262-267
PUBMED DOIProline-Rich Hypervariable Region of Hepatitis E Virus: Arranging the Disorder.
• Muñoz-Chimeno M, Cenalmor A, García-Lugo MA, Hernandez M, David Rodríguez-Lazaro D, Avellón A. Proline-Rich Hypervariable Region of Hepatitis E Virus: Arranging the Disorder. Microorganisms. 2020 Sep 15;8(9):1417.
PUBMED DOIClinical performance of Determine HBsAg 2 rapid test for Hepatitis B detection.
• Avellón A, Ala A, Diaz A, Domingo D, González R, Hidalgo L, Kooner L, Loganathan S, Martin D, McPherson S, Muñoz-Chimeno M, Ryder S, Gabrielle Slapak G, Ryan P, Valbuena M, Kennedy PT. Clinical performance of Determine HBsAg 2 rapid test for Hepatitis B detection. J Med Virol. 2020 Apr 9.
PUBMED DOIHepatitis E virus genotype 3 microbiological surveillance by the Spanish Reference Laboratory: geographic distribution and phylogenetic analysis of subtypes from 2009 to 2019.
• Muñoz-Chimeno M, Bartúren S, García-Lugo MA, Morago L, Rodríguez A, Galán JC, Pérez-Rivilla A, Rodríguez M, Millán R, Del Álamo M, Alonso R, Molina L, Aguinaga A, Avellón A. Hepatitis E virus genotype 3 microbiological surveillance by the Spanish Reference Laboratory: geographic distribution and phylogenetic analysis of subtypes from 2009 to 2019. Euro Surveill. 2022 Jun;27(23):2100542.
PUBMED DOIHepatitis E virus: Assessment of the epidemiological situation in humans in Europe
• Adlhoch C, Avellón A, Baylis SA, Ciccaglione AR, Couturier E, de Sousa R, Epštein J, Ethelberg S, Faber M, Fehér A, Ijaz S, Lange H, Manďáková Z, Mellou K, Mozalevskis A, Rimhanen-Finne R, Rizzi V, Said B, Sundqvist L, Thornton L, Tosti ME, van Pelt W, Aspinall E, Domanovic D, Severi E, Takkinen J, Dalton HR. Hepatitis E virus: Assessment of the epidemiological situation in humans in Europe, 2014/15. J Clin Virol. 2016 Sep;82:9-16.
PUBMED DOIEmergence of linezolid-resistant coagulase-negative staphylococci in an intensive care unit
2. Emergence of linezolid-resistant coagulase-negative staphylococci in an intensive care unit. Balandin B, Lobo B, Orden B, Román F, García E, Martínez R, Valdivia M, Ortega A, Fernández I, Galdos P. Infect Dis (Lond). 2016;48(5):343-9.
PUBMED DOIHorizontal gene transmission of the cfr gene to MRSA and Enterococcus: role of Staphylococcus epidermidis as a reservoir and alternative pathway for the spread of linezolid resistance.
3. Horizontal gene transmission of the cfr gene to MRSA and Enterococcus: role of Staphylococcus epidermidis as a reservoir and alternative pathway for the spread of linezolid resistance. Cafini F, Nguyen le TT, Higashide M, Román F, Prieto J, Morikawa K. J Antimicrob Chemother. 2016 Mar;71(3):587-92.
PUBMED DOIContent with Investigacion .
-
Carmen Marcos Moreno
Ayudante de Investigación de OPIs
-
Antonio Javier Martín Galiano
Investigador Miguel Servet II
-
Mireia López Siles
Investigadora Posdoctoral
-
Andrés Corral Lugo
Investigador Posdoctoral
-
Ana Tajuelo Moreno-Palancas
Investigadora predoctoral
-
Marta Vicente Pazos
Investigador predoctoral
-
Astrid Pérez Gomez
Investigador posdoctoral
-
Mar Cordero Alba
Investigador posdoctoral
-
Sonia Prieto Martín Gil
Investigador predoctoral
-
Beatriz Cano Castaño
Investigador predoctoral
-
Michael McConnell
Científico Titular
-
Federico Román Alonso
Científico Titular de OPIs
-
Miriam García López
Contratada predoctoral pFIS
-
María Dolores Pérez Vázquez
Científica Titular OPI
Licenciada y doctora en Farmacia (Universidad de Santiago de Compostela, Universidad Complutense de Madrid). Especialista en Microbiología y Parasitología clínicas (F.I.R.). Mi trayectoria investigadora se ha centrado en la resistencia a los antibióticos y la epidemiología de patógenos resistentes, desarrollándose principalmente en el Centro Nacional de Microbiología (ISCIII), así como en el ámbito hospitalario (HU Ramón y Cajal) y en el Wellcome Sanger Institute (Cambridge). Desde 2012, tras mi formación en bioinformática, he consolidado una línea de investigación basada en la secuenciación masiva (WGS) aplicada a la vigilancia microbiológica, promoviendo la creación de la RedLabRA para la vigilancia nacional de bacterias multirresistentes. Mi producción científica alcanza 111 publicaciones (7056 citas; h-index 39/36) y he destacado por integrar investigación, vigilancia y transferencia al Sistema Nacional de Salud, junto con una sólida actividad docente y formadora.
-
Noelia Lara Fuella
Técnico Superior
ORCID code: 0009-0004-8912-7741
Noelia Lara Fuella (NLF) es Técnica Superior Especialista en Anatomía Patológica y Citología, con amplia experiencia en técnicas fenotípicas y genotípicas de identificación de mecanismos de resistencia en enterobacterias y gran positivos, amplia experiencia en técnicas de biología molecular, incluyendo aislamiento de ADN, PCR, RT-Y qPCR, campo Pulsante, preparación de librerías para su posterior análisis por secuenciación masiva, análisis de secuencias mediante herramienta Galaxy. Posee experiencia en manipulación de animales, realizando técnicas de inoculación y posterior sangrado para realización de posteriores ensayos, cultivo de células tumorales y mantenimiento de líneas celulares. Su trayectoria investigadora abarca un periodo de 22 años llevados a cabo en el Centro Nacional de Microbiología, en el Laboratorio de Referencia e Investigación en Resistencia a Antibióticos e IRAS, durante todo este tiempo NLF ha sido clave para la realización y puesta a punto de diversas técnicas moleculares y pruebas diagnósticas del programa de vigilancia de Haemophilus Influenzae y Programa de Vigilancia de Resistencia a Antibióticos donde permanece en la actualidad.
-
Verónica Casquero García
Técnico Superior Especializado de OPIs
ORCID code: 0000-0002-2365-394X
Verónica Casquero García es Licenciada en Bioquímica y en Biología, con amplia experiencia en técnicas de biología molecular, incluyendo aislamiento de ADN y ARN, PCR, RT- y qPCR, clonaje, mutagénesis dirigida, silenciamiento génico mediante shRNA y edición génica con CRISPR-Cas9. Posee experiencia en cultivo y manipulación de células madre embrionarias de ratón, células primarias de ratón y humano y líneas celulares, así como en técnicas de bioquímica de proteínas y en microscopía. Su trayectoria investigadora abarca varios centros incluyendo CSIC, CNIC y CNIO. Desde su incorporación al CNM en el Laboratorio de Referencia e Investigación en Resistencia a Antibióticos e IRAS ha sido clave en la actualización y desarrollo de técnicas moleculares y pruebas diagnósticas del Programa de Vigilancia en Infecciones Estafilocócicas. Domina la extracción de ADN/ARN bacteriano de distintos tipos de muestras y la preparación de librerías para secuenciación genómica, metagenómica y metatranscriptómica.
-
Jesús Oteo Iglesias
Investigador Científico OPI
ORCID code: 0000-0003-3327-8263
Licenciado en Medicina y Cirugía en 1992 y Doctor en 2005 por la Universidad Complutense de Madrid. Realizó la especialidad en Microbiología y Parasitología en el Hospital de Móstoles (2000) y desde 2001 ha desarrollado su carrera profesional en el CNM del ISCIII, del cual fue Director entre 2019-2021 liderando el plan de acción del CNM-ISCIII frente a la pandemia de COVID-19. Es profesor de investigación de OPIs, director científico del CIBER de Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), coordinador de la Red Nacional de Laboratorios para la Vigilancia de Microorganismos Resistentes (RedLabRA) y National Focal Point español en resistencia a antimicrobianos. Su actividad investigadora está centrada en el campo de la resistencia a antibióticos, ha publicado más de 200 artículos en revistas con índice de impacto y ha sido investigador principal de numerosos proyectos. Ha sido secretario científico de la Junta Directiva de la SEIMC, y presidente de su grupo para el estudio de los mecanismos de acción y resistencia a antibióticos (GEMARA).
-
Silvia García Cobos
Investigador Posdoctoral
ORCID code: 0000-0002-1417-5691
Doctora en Biología por la Universidad Complutense de Madrid (2009), realizó su tesis en el Centro Nacional de Microbiología (CNM) del Instituto de Salud Carlos III, donde investigó los mecanismos de resistencia a antibióticos β-lactámicos en Haemophilus influenzae. Continuó su investigación en el mismo centro hasta el 2013, especializándose en la caracterización molecular de mecanismos de resistencia a antibióticos y su vigilancia epidemiológica, colaborando en redes nacionales como REIPI. Entre 2013 y 2019 desarrolló su labor en el University Medical Center Groningen (UMCG), Países Bajos, donde aplicó la secuenciación completa de genomas en el estudio de la diseminación de bacterias resistentes a los antibióticos bajo el enfoque One Health y la colaboración transfronteriza (programa INTERREG), además de investigar el resistoma intestinal humano en proyectos europeos de investigación. En 2019 regresó a España con financiación del programa Atracción de Talento de la Comunidad de Madrid para iniciar una línea de investigación sobre el papel del microbioma humano en las enfermedades infecciosas bacterianas y la resistencia a antibióticos, mediante secuenciación y análisis de datos metagenómicos y metatranscriptómicos.
-
María Belén Aracil García
Científica Titular OPI
ORCID code: 0000-0002-6156-8252
Licenciada y doctora en Medicina y Cirugía (Universidad Autónoma de Madrid, y Universidad Complutense de Madrid, respectivamente). Especialista en Microbiología y Parasitología clínicas (M.I.R.). Experiencia clínica en enfermedades infecciosas y microbiología desarrollada en el ámbito hospitalario (HU de Móstoles y HM Hospitales- Madrid-Montepríncipe) y en el Laboratorio de Referencia e Investigación de .Resistencia a Antibióticos y Enfermedades Relacionadas con la Asistencia Sanitaria (IRAS) del Centro Nacional de Microbiología del Instituto de Salud Carlos III, donde desde 2000 se ha desarrollado también mi actividad investigadora, enfocada en el estudio de la resistencia a los antibióticos esencialmente en patógenos multirresistentes gnosocomiales desde el punto de vista de la epidemiología molecular y la salud pública. Desde 2012, responsable de calidad del laboratorio, punto focal alternate de resistencia a antibióticos en España y coordinadora de la red EARS-Net en España, red del ECDC para la vigilancia de la resistencia a antibióticos en infecciones invasivas causadas por los principales microorganismos involucrados en la multirresistencia. Labor formativa de posgrado en la Universidad de Alcalá y la UNED y en otros ciclos formativos relacionados. Destacada producción científica con 114 publicaciones e informes técnicos y 30 proyectos de investigación.
-
Isabela Alonzo González
Dra.
ORCID code: 0009-0007-4291-4870
La Dra. Isabela Alonso González es licenciada en Biología por la Universidad Complutense de Madrid, en 2002. Realizó su tesis doctoral en el ámbito de la regulación de la expresión génica en células de mamífero en el Centro de Biología Molecular Severo Ochoa (CBMSO-UAM), donde concluyó su doctorado en Biología Molecular en 2009. Tras varias estancias posdoctorales, se especializó mediante un Máster en Gestión de Proyectos de I+D y es experta en la coordinación y gestión de redes de investigación. Desde 2023 trabaja como Project Manager del proyecto MePRAM, contratada por el CIBER y, en paralelo, desarrolla su labor en el Centro Nacional de Microbiología (CNM) en el grupo de investigación del Dr. Jesús Oteo, explorando oportunidades en una nueva línea de trabajo relacionada con la proteómica y la resistencia a antimicrobianos en patógenos de interés para el Sistema Nacional de Salud (SNS), así como en el estudio de nuevas terapias celulares frente a las infecciones producidas por bacterias multirresistentes.
List of staff