AIDS Immunopathology
Research Lines
Content with Investigacion .
Infecciones Víricas e Inmunidad en Enfermos Inmunodeprimidos
Nuestras líneas de investigación se centran en distintas áreas del conocimiento relacionadas con hepatitis virales crónicas (Hepatitis B, C y D), VIH, y SARS-CoV-2:
- Inmunopatogenia de las infecciones virales y su relación con eventos clínicos.
- Impacto en el organismo del control o eliminación de la infección viral.
- Biopsia líquida y ómicas: biomarcadores de enfermedad en infección viral.
- Resistencia a la infección viral y aclaramiento espontáneo.
- Cribado de infección viral y epidemiología molecular de los virus.
- Desarrollo de kits de diagnóstico rápido.
- Respuesta inmune a vacunas.
Infección por CMV en pacientes trasplantados
En los últimos años en nuestro grupo hemos estudiado la cinética de infección por CMV y el desarrollo de la respuesta inmune protectora específica frente a CMV. Como resultados de estos estudios hemos sido capaces de caracterizar la cinética y magnitud de la adquisición de la respuesta inmune frente a CMV y establecer puntos de corte de inmunidad específica que se relacionan con la protección frente a la infección.
El objetivo de esta línea de investigación en los últimos años ha sido definir parámetros relacionados con la respuesta inmune específica frente a CMV y con factores genéticos que puedan estar relacionados con el control de la infección y enfermedad por CMV. El estudio de estas variables de forma conjunta como marcadores de predicción del riesgo de desarrollo de infección/enfermedad y de la evolución de la infección tras el trasplante permitirían establecer un algoritmo para el manejo de los pacientes. Además, permitirían definir niveles mínimos de protección que sirvan de endpoints para el desarrollo de una vacuna. Esta línea de investigación se enmarca dentro del programa de Infecciones en Transplantes de la Red Española de Investigación en Patologías Infecciosas (REIPI), como parte del WP2 denominado Optimización de la prevención de la enfermedad por CMV.
Desarrollo preclínico de vacunas protectoras frente a CMV
La vacuna ideal frente a CMV debería estar compuesta por múltiples antígenos y ser capaz de imitar el efecto producido por la infección natural, y estimular una respuesta inmune específica combinada tanto de células T como de anticuerpos neutralizantes. Sin embargo, a pesar de los esfuerzos realizados y los progresos de los últimos años, los resultados obtenidos en el desarrollo de una vacuna frente a CMV no han mostrado resultados definitivos.
Por tanto, el objetivo de esta línea de investigación es promover aproximaciones innovadoras para el diseño y desarrollo de una vacuna frente a la infección por CMV. Para ello se ha puesto en marcha una aproximación a través de la construcción de un plásmido optimizado para generar una respuesta inmune combinada y amplia específica frente a CMV y la búsqueda de los antígenos candidatos, a través del estudio de la inmunogenicidad in vivo del proteoma completo de CMV.
Desarrollo preclínico de alternativas terapéuticas frente a CMV basadas en la inmunoterapia
La inmunidad mediada por células T constituye una respuesta adaptativa fundamental y representa el mecanismo de defensa más importante frente a la infección viral. Por otra parte, la presencia en suero de anticuerpos neutralizantes se han asociado con tasas más bajas de transmisión del CMV de la madre al feto y en los receptores de trasplante de órgano sólido.
El presente proyecto propone un enfoque novedoso a través de la identificación y caracterización de la respuesta inmune tanto celular como de anticuerpos en pacientes que han sido inmunizados de forma natural y están protegidos frente a la infección por CMV, para abordar el desarrollo preclínico de alternativas terapéuticas basadas en la transferencia adoptiva de células T CD8+ citotóxicas y de anticuerpos monoclonales específicos de CMV con el objetivo de desarrollar una nueva estrategia terapéutica para el tratamiento frente a la infección por este patógeno.
Estudio del desarrollo de inmunidad frente a SARS-CoV-2
Dada la situación producida como consecuencia de la propagación del SARS-CoV-2 urge la realización de estudios serológicos que nos ayuden a determinar el alcance y la duración de la inmunidad adquirida por la población infectada por SARS-CoV-2 que ha superado la enfermedad. En este sentido el estudio de los anticuerpos neutralizantes, que son aquellos que reconocen las proteínas del virus implicadas en el reconocimiento del receptor celular bloqueando su capacidad infectiva, en pacientes recuperados de la infección por SARS-CoV-2 podrían ser clave para explicar el pronóstico de la enfermedad en estos pacientes. Además son necesarios estudios que estudien la cinética de la inmunidad de anticuerpos específicos frente a coronavirus y su relación con la evolución de la enfermedad que nos permitan establecer estrategias de manejo de los pacientes en base a su patrón inmunológico.
También participamos en el desarrollo de un prototipo de vacuna basado en ADN plasmídico que expresa antígenos de SARS-CoV-2 y la caracterización de la respuesta inmune inducida por esta vacuna en un modelo murino de inmunización.
Research projects
Content with Investigacion .
Proyectos del Plan Nacional.
1. Título del proyecto: Characterization of the antibody immune response against CMV in transplant patients for vaccine design.
Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III
Expediente: PI20CIII/00009
Financiación: 92.000 € + 1 contrato de Técnico Superior 2 años Duración: 2021-2024
Investigador Principal: Pilar Pérez Romero
2. Título del proyecto: STOP-Coronavirus: factores clínicos, inmunológicos, genómicos, virológicos y bioéticos de COVID-19.
Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III
Expediente: COV20/00181
Financiación: 1.200.000,00 € Duración: 2020-2021
3. Título del proyecto: Coordinación de actividades de investigación en el CNM para realizar una respuesta integradora frente a la pandemia por SARS-COV2 en España.
Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III
Expediente: COV20/00679
Financiación: 325.909,46€ Duración: 2020-2021
4. Título del proyecto: Desarrollo preclínico de vacunas de ADN frente a CMV a través de análisis inmunogénico del proteoma completo de CMV.
Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III (Proyecto de Desarrollo Tecnológico)
Expediente: DTS18CIII/00005
Financiación: 98.400€ Duración: 2019-2021
Investigador Principal: Pilar Pérez Romero
5. Título del proyecto: Score integrado de factores inmunológicos y genotípicos de predicción del riesgo y evolución de la infección por CMV en pacientes con trasplante renal.
Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III
Expediente: P17CIII/00016
Financiación: 94.700€ Duración: 2018-2021
Investigador Principal: Pilar Pérez Romero
6. Título del proyecto: ACINETOCLINIC: Transición a fase clínica de investigación para licencia de la primera vacuna contra Acinetobacter baumannii drogorresistente.
Entidad financiadora: Ministerio de Economía y Competitividad
Expediente: RTC-2016-5161-1
Financiación: 147.104,40€ Duración: 2016-2019
Co-Investigadores Principales: Pilar Pérez Romero, Michael McConnell, Jerónimo Pachón
7. Título del proyecto: Búsqueda de antígenos virales capaces de estimular una respuesta inmune protectora frente a la infección por CMV para el diseño de una vacuna.
Entidad financiadora: Instituto de Salud Carlos III
Expediente: PI14/01291
Financiación: 121.000€ Duración: 2015-2017
Investigador Principal: Pilar Pérez Romero
Otros proyectos.
1. Título del Proyecto: Estudio de la cinética y reactividad de los anticuerpos neutralizantes en pacientes recuperados de COVID-19.
Entidad financiadora: Fundación Mutua Madrileña
Financiación: 80.000 € Duración: 2020-2021
Investigador Principal: José Mª Aguado y Pilar Pérez Romero
2. Título del Proyecto: SARSVAX: Development of a multi-epitope vaccine for SARS-CoV-2 using the PLASMIVAX vaccine platform.
Entidad financiadora: Caixa-Impulse
Financiación: 300.000 € Duración: 2020-2021
3. Título del Proyecto: Investigación de anticuerpos frente a Acinetobacter baumannii.
Entidad financiadora: Vaxdyn S.L
Expediente: MVP 210/18
Financiación: 40.400 € Duración: 2018-2020
Investigador Principal: Pilar Pérez Romero y Michael McConnell
4. Título del proyecto: Caracterización físico-química y biológica de principio activo conteniendo antígenos virales.
Entidad financiadora: Bionaturis SL.
Financiación: 57.290 €. Duración: 2015-2017
Investigadora Principal: Pilar Pérez Romero
5. Título del Proyecto: BIOMAP: Biomolecules design through multivariate analysis process for obtaining active compounds.
Entidad financiadora: CDTI Ministerio de Ciencia e Innovación Programa INNTERCONECTA Expediente:ITC-20151294
Financiación (IBiS): 107.000 € Duración: 2015-2017
6. Título del proyecto: Diseño y desarrollo preclínico de una vacuna trivalente frente a la infección por citomegalovirus.
Entidad financiadora: Consejería de Economía, Ciencia y Empresa, Junta de Andalucía
Expediente: CTS 1909
Financiación: 43.100 € Duración: 2014-2017
Investigador Principal: Pilar Pérez Romero.
7. Título del Proyecto: ADELIS: "Andalusian Drug Delivery Injectable Systems"
Entidad financiadora: CDTI Ministerio de Ciencia e Innovación Programa INNTERCONECTA
Expediente: ITC-20131036
Financiación (IBiS): 1,3M € Duración: 2013-2015
Investigador Principal: Pilar Pérez Romero.
Publications
Protein Saver® cards: the best alternative for DBS storage at room temperature for HCV RNA.
Arca-Lafuente S, Casanueva-Benítez C, Crespo-Bermejo C, Lara-Aguilar V, Martín-Carbonero L, De los Santos I, Madrid R, Briz V*. Protein Saver® cards: the best alternative for DBS storage at room temperature for HCV RNA. 903 Scientific Report 2022, 12: 10124.
PUBMED DOIDiarrhoea-causing enteric protist species in intensively and extensively raised pigs (Sus scrofa domesticus) in Southern Spain. Part II: Association with Hepatitis E virus susceptibility.
Rivero-Juarez A, Dashti A, Santín M, George, Köster PC, Lopez-Lopez P, Risalde MA, García-Bocanegra I, Gomez-Villamandos JC, Caballero-Gómez J, Frías M, Bailo B, Ortega S, Muadica AS, Calero-Bernal R, González-Barrio D, Rivero A, Briz V*, Carmena D. Diarrhoea-causing enteric protist species in intensively and extensively raised pigs (Sus scrofa domesticus) in Southern Spain. Part II: Association with Hepatitis E virus susceptibility. Transboundary and Emerging Diseases 2021, 69: e1172-e1178.
PUBMED DOIHepatitis C virus influences HIV-1 viral splicing in coinfected patients.
Martínez-Román P, López-Huertas MR, Crespo-Bermejo C, Arca-Lafuente S, Cortegano I, Valle-Millares D, Gaspar ML, Martín-Carbonero, Domínguez-Domínguez L, Ryan P, De los Santos I, De la Fuente Moral S, Fernández-Rodríguez A, Coiras M, Briz V, on behalf of COVIHEP. Hepatitis C virus influences HIV-1 viral splicing in coinfected patients. J Clin Med 2020, 9 (7): 2091.
PUBMED DOIrotist enteroparasites in wild boar (Sus scrofa ferus) and black Iberian pig (Sus scrofa domesticus) in southern Spain: a protective effect on hepatitis E acquisition?
Rivero-Juárez A, Dashti A, López-López P, Salimo Muadica A, Risalde MA, Köster PC, Machuca I, Bailo B, Hernández de Mingo M, Dacal E, García-Bocanegra I, Saugar JM, Calero-Bernal R, González-Barrio D, Rivero A, Briz V, Carmena D. Protist enteroparasites in wild boar (Sus scrofa ferus) and black Iberian pig (Sus scrofa domesticus) in southern Spain: a protective effect on hepatitis E acquisition? Parasites & Vectors 2020, 13: 281
PUBMED DOIAdditional Information
The AIDS Immunopathology Unit has been coordinated since 2000 by Dr. José Alcamí, bringing together during its history more than 20 independent researchers who collaboratively study different aspects of HIV infection. During this years, more than 30 visiting researchers and more than 50 national and international students have passed through the unit. From the beginning of the year 2025, Javier García Pérez and Francisco Díez Fuertes assumed the coordination of the AIDS Immunopathology Unit, with the aim of projecting its scientific competitiveness following multidisciplinary approaches and through the maintenance of the current close collaborations, as well as the promotion of participation in new national and international research networks.
Historically, the current members of the unit have focused on different lines of basic research that include the study of antibodies and the development of vaccines against HIV-1, the study of viral entry and tropism of the virus or the study of the host through the genomic characterization of populations with an extreme phenotype. Currently, the activity of our unit in the field of HIV-1 is focused on three main lines:
1. Mecanismos moleculares asociados a la protección de la infección por VIH-1 en pacientes con distrofia muscular de cinturas dominante D2 (LGMDD2).
2. Generación de anticuerpos neutralizantes de uso terapéutico basados en la respuesta neutralizante de amplio espectro frente a virus fundadores.
3. Cribado y caracterización de nuevos fármacos anti-latencia frente al VIH-1.
A partir del año 2020, nuestra unidad se vuelca con la investigación sobre COVID-19, participando y liderando diferentes proyectos de investigación aplicada y clínica. Fruto de esta fuerte implicación en el campo, en la actualidad se mantienen diferentes estudios sobre la caracterización de la respuesta inmune frente a SARS-CoV-2, integrando diferentes técnicas de virología molecular, estrategias de inteligencia epidemiológica y tecnologías de célula única.
We also participate in different research consortiums and networks, such as the Spanish AIDS Research Network or the Center for Biomedical Research in Infectious Diseases Network (CIBER-INFEC), in which we participate as researchers in different lines and work packages within the research programs “Global Health, emerging and re-emerging infections” as well as “HIV/AIDS and sexually transmitted infections”.
Supervised doctoral theses
1. GENOMIC AND FUNCTIONAL ANALYSIS OF HIV-1 PROTECTION PARAMETERS IN PATIENTS WITH SLOW PROGRESSION OF INFECTION.
Student: Erick de la Torre Tarazona.
Supervisors: José Alcamí and Francisco Díez Fuertes.
Academic entity: Universidad Autónoma de Madrid.
Defense date: July 14th, 2020.
2. ANALYSIS OF MIARN EXPRESSION PROFILES AND FUNCTIONAL CHARACTERIZATION IN HIV-POSITIVE INDIVIDUALS WITH DIFFERENT PROGRESSION TO AIDS.
Student: Rubén Ayala Suárez.
Supervisors: José Alcamí and Francisco Díez Fuertes.
Academic entity: Universidad de Alcalá.
Defense date: June 12nd, 2023.
The AIDS Immunopathology Unit has been coordinated since 2000 by Dr. José Alcamí, bringing together during its history more than 20 independent researchers who collaboratively study different aspects of HIV infection. During this years, more than 30 visiting researchers and more than 50 national and international students have passed through the unit. From the beginning of the year 2025, Javier García Pérez and Francisco Díez Fuertes assumed the coordination of the AIDS Immunopathology Unit, with the aim of projecting its scientific competitiveness following multidisciplinary approaches and through the maintenance of the current close collaborations, as well as the promotion of participation in new national and international research networks.
Historically, the current members of the unit have focused on different lines of basic research that include the study of antibodies and the development of vaccines against HIV-1, the study of viral entry and tropism of the virus or the study of the host through the genomic characterization of populations with an extreme phenotype. Currently, the activity of our unit in the field of HIV-1 is focused on three main lines:
1. Mecanismos moleculares asociados a la protección de la infección por VIH-1 en pacientes con distrofia muscular de cinturas dominante D2 (LGMDD2).
2. Generación de anticuerpos neutralizantes de uso terapéutico basados en la respuesta neutralizante de amplio espectro frente a virus fundadores.
3. Cribado y caracterización de nuevos fármacos anti-latencia frente al VIH-1.
A partir del año 2020, nuestra unidad se vuelca con la investigación sobre COVID-19, participando y liderando diferentes proyectos de investigación aplicada y clínica. Fruto de esta fuerte implicación en el campo, en la actualidad se mantienen diferentes estudios sobre la caracterización de la respuesta inmune frente a SARS-CoV-2, integrando diferentes técnicas de virología molecular, estrategias de inteligencia epidemiológica y tecnologías de célula única.
We also participate in different research consortiums and networks, such as the Spanish AIDS Research Network or the Center for Biomedical Research in Infectious Diseases Network (CIBER-INFEC), in which we participate as researchers in different lines and work packages within the research programs “Global Health, emerging and re-emerging infections” as well as “HIV/AIDS and sexually transmitted infections”.
Supervised doctoral theses
1. GENOMIC AND FUNCTIONAL ANALYSIS OF HIV-1 PROTECTION PARAMETERS IN PATIENTS WITH SLOW PROGRESSION OF INFECTION.
Student: Erick de la Torre Tarazona.
Supervisors: José Alcamí and Francisco Díez Fuertes.
Academic entity: Universidad Autónoma de Madrid.
Defense date: July 14th, 2020.
2. ANALYSIS OF MIARN EXPRESSION PROFILES AND FUNCTIONAL CHARACTERIZATION IN HIV-POSITIVE INDIVIDUALS WITH DIFFERENT PROGRESSION TO AIDS.
Student: Rubén Ayala Suárez.
Supervisors: José Alcamí and Francisco Díez Fuertes.
Academic entity: Universidad de Alcalá.
Defense date: June 12nd, 2023.




