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Investigación

Mecanismos de resistencia a antifúngicos en Aspergillus

Líneas de investigación

Contenidos con Investigacion Mecanismos de resistencia a antifúngicos en Aspergillus .

Mecanismos de Resistencia de Aspergillus fumigatus a los antifúngicos

Aspergillus fumigatus es un hongo patógeno oportunista de distribución universal, que tiene una incidencia mundial muy significativa y una mortalidad elevadísima.  El uso extensivo y generalizado de los antifúngicos ha originado la aparición de A. fumigatus resistentes a los mismos, ocasionando graves consecuencias para los pacientes infectados por estos aislados que ven reducidas sus opciones terapéuticas. 

Inicialmente la aparición de cepas resistentes fue muy esporádica y mostraban mutaciones puntuales en zonas clave del enzima Cyp51A (G54, G138, F219, M220, G448S) en las cepas que se aislaban en pacientes sometidos a tratamientos de larga duración con azoles. Esta ruta clínica es debida a la presión selectiva que los azoles ejercen sobre A. fumigatus en el interior del paciente. Sin embargo, desde el año 2014 la resistencia ha crecido de manera notable y casi todas las cepas de A. fumigatus resistentes a los azoles tienen un mecanismo combinado de modificaciones en el promotor y la parte codificante de cyp51A (TR34/L98H o TR46/Y121F/T289A) y que, con una elevada frecuencia, se detectan en pacientes que jamás han sido expuestos a terapia antifúngica. En estos casos se plantea la implicación de una ruta ambiental en la que la exposición no intencionada de A. fumigatus a DMIs en el campo estaría favoreciendo la aparición de aislados resistentes.

 

Origen y Evolución de la Resistencia de A. fumigatus a los antifúngicos

Hoy en día, el aislamiento de cepas de A. fumigatus resistentes a antifúngicos es una emergencia global en aumento. Se cree que la exposición continuada de A. fumigatus a fungicidas ambientales, utilizados para la protección de cultivos contra otras especies de hongos que causan daños agrícolas, está seleccionando cepas resistentes a múltiples fármacos. Los principales mecanismos de resistencia a los azoles en A. fumigatus son cepas con modificaciones de la diana de los azoles (gen cyp51A), principalmente el TR34/L98H, seguido por TR46/Y121F/A289T. Ambos tipos de mecanismos son responsables de la resistencia a todos los azoles y cruzada a los DMI utilizados para la protección de cultivos (imidazoles y triazoles). Más recientemente, también se ha reconocido la resistencia a varias clases de fungicidas como, Bencimidazoles (MBC), Estrobilurinas (QoIs), inhibidores de la sucinato deshidrogenasa (SDHIs) y Dicarboximidas.


La caracterización genomica (NGS) de cepas procedentes tanto de origen clínico como ambiental permite vincular las diferencias del genoma con la adquisición de resistencia a distintos fungicidas. Al añadir los datos de susceptibilidad a antifúngicos no azólicos se puede observar una imagen más precisa de las relaciones filogenéticas entre las cepas ya que se forman distintos subclados en los que coinciden las cepas multirresistentes a los antifúngicos no azólicos, con cepas resistentes a los azoles con los mecanismos TRs. Esta formación de clados específicos con cepas que difieren en cuanto a origen geográfico y año de aislamiento sugiere la existencia de un nexo común, un punto de origen evolutivo según el cual las cepas se han desarrollado bajo unas circunstancias similares que confluyen en una serie de mecanismos de multirresistencia a fungicidas de distintas familias. Los funqicidas no azolicos son de uso exclusivo ambiental, y la resistencia de A. fumigatus a los mismos confirma que las cepas con mecanismo de resistencia a TRs, se seleccionan y desarrollan en el ambiente donde se ven expuestos a la presión selectiva de múltiples fungicidas.

Se cree que las cepas con mecanismos TRs podrían estar asociadas a una ventaja evolutiva o mejora en su "fitness" que pueda favorecer su supervivencia y dispersión en un ambiente muy cargado de fármacos. Esta tendencia de las cepas a adquirir multitud de mutaciones responsables de resistencia a varias familias de fármacos nos ha hecho explorar las alteraciones de los genes de la vía de reparación del ADN. 

Tolerancia y persistencia a los antifúngicos azólicos en Aspergillus fumigatus

La tolerancia y la persistencia son dos fenómenos por los cuales los organismos patógenos pueden sobrevivir la acción microbicida de antimicrobianos que deberían matarlos durante un período de tiempo extendido. En el laboratorio investigamos la capacidad de algunos aislados de A. fumigatus de mostrar tolerancia y persistencia a los azoles, primera línea de tratamiento antifúngico contra las infecciones de aspergilosis. Por una parte, desarrollamos metodología para detectar e investigar la tolerancia/persistencia, tanto en el laboratorio como en diagnóstico clínico. Con estos métodos estamos estudiando los mecanismos moleculares y genómicos subyacentes que posibilitan estos fenómenos. Por último, estamos investigando la potencial relevancia de la tolerancia y la persistencia en la eficacia del tratamiento antifúngico.

Modulación diferencial de la persulfidación en el hongo y el hospedador como nueva estrategia antifúngica

La persulfidación es una modificación postraduccional en la cual un grupo sulfuro activado (S2), mediante la acción de una enzima, realiza un ataque nucleofílico específico sobre grupos tiol (-SH) de residuos cisteína en proteínas diana para formar un grupo persulfido (-SSH). Se ha demostrado que esta alteración modula la actividad intrínseca de las proteínas, resultando en un papel relevante en diversos mecanismos celulares y funciones fisiológicas. En nuestra investigación previa demostramos que niveles correctos de persulfidación son importantes tanto para la virulencia de A. fumigatus, como para la orquestación de una respuesta inmunitaria adecuada en el hospedador. Por tanto, en esta línea de investigación estudiamos la hipótesis de que la modulación diferencial de la persulfidación puede constituir una nueva estrategia para el tratamiento antifúngico. Por una parte, estamos investigando la capacidad de compuestos de inhibir la acción de enzimas fúngicas que realizan la persulfidación, con el objetivo de reducir los niveles de persulfidación y por tanto disminuir la virulencia de A. fumigatus. Por otra parte, estudiamos el uso de donadores de sulfuro como potenciales vías para incrementar la persulfidación en las células pulmonares del hospedador, con el objetivo de potenciar la respuesta inmunitaria. 

Evolución de las resistencias cruzadas a los nuevos antifúngicos olorofim y manogepix

La resistencia a los azoles se encentra ya presente a nivel global. Se ha demostrado que los mecanismos de resistencia más comunes (consistentes en la repetición en tándem de secuencias en el promotor del gen que codifica la diana de los azoles) se han desarrollado en el campo, debido a la utilización indiscriminada de pesticidas de la misma familia que los azoles clínicos. En este momento, existen dos nuevos antifúngicos clínicos con nuevos mecanismos de acción molecular, el olorofim y el manogepix. Sin embargo, también se han desarrollado análogos para su uso como pesticidas, con el mismo mecanismo de acción, el ipflufenoquin y el aminopyrifen. Por tanto, estamos en riesgo de cometer el mismo error que con los azoles. En este proyecto de colaboración internacional, estudiamos la evolución de resistencias y cros-resistencias a estos antifúngicos clínicos y ambientales, con el objetivo de poder diseñar estrategias para minimizar la aparición de resistencias en el ambiente y para desarrollar métodos de detección temprana de las resistencias.

Proyectos de investigación

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TITULO DEL PROYECTO: Consorcio Centro de Investigacion Biomedica en Red (CIBER).  Área de Enfermedades Infecciosas. 
ENTIDAD FINANCIADORA: CIF: G85296226.  Expediente CB21/13/00105
DURACIÓN: 2022-2026            DOTACION: 85.000 € (primer año)
IP: Emilia Mellado Terrado 


 

TÍTULO DEL PROYECTO: Modulación diferencial de la persulfidación en el hongo y el hospedador como nueva estrategia antifúngica. 
Entidad financiadora: Agencia Estatal de Investigación (Convocatoria Proyectos de Generación de Conocimiento"
Referencia: Proyecto PID2022-136343OA-I00 financiado por MICIU/AEI /10.13039/501100011033 y por FEDER, UE
IP: Jorge Amich. 
Duración: 2024-2026. 
Financiación 118.750 €


 

TITULO DEL PROYECTO: Bridging the gap between environment and patient JPIAMR (AC23CIII_2/00002 (JPIAMR2023-DISTOMOS-103). 
DURACIÓN: 2024-2026            DOTACION: 178.000 €
IP: Jorge Amich. 

TITULO DEL PROYECTO: Buscando los rasgos geneticos de la resistencia de Aspergillus fumigatus a los azoles para preservar la eficacia de los azoles:un enfoque de salud global.
ENTIDAD FINANCIADORA: Fondo de Investigación Sanitaria. PI21CIII/00028_ MPY443/2021
DURACIÓN: 2022-2025            DOTACION: 47.000 €
IP: Emilia Mellado Terrado 

TITULO DEL PROYECTO: Persistencia a antifúngicos azólicos en Aspergillus fumigatus: mecanismos, relevancia y diagnóstico. 
ENTIDAD FINANCIADORA: AESI 2022 (PI22CIII/00053). 
DURACIÓN: 2023-2025            DOTACION: 55.000 €
IP: Jorge Amich. 

TITULO DEL PROYECTO: La medicina de precisióncontra la resistencia a antimicrobianos:
CONSORCIO CENTRO DE INVESTIGACION BIOMEDICA EN RED (CIBER) CENTRO NACIONAL DE MICROBIOLOGIA
G85296226 PMP22/00092 Proyecto MePRAM 28.107.46QF.749   DOTACION: 4.339.500,00€
IP: Jesus Oteo 

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Treatment of Chronic Pulmonary Aspergillosis: Current Standards and Future Perspectives. Respiration. 2018 Jul

Alastruey-Izquierdo A, Cadranel J, Flick H, Godet C, Hennequin C, Hoenigl M, Kosmidis C, Lange C, Munteanu O, Page I, Salzer HJF; on behalf of CPAnet. Treatment of Chronic Pulmonary Aspergillosis: Current Standards and Future Perspectives. Respiration. 2018 Jul 6:1-12. doi: 10.1159/000489474. [Epub ahead of print] Review. PMID: 29982245.

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The Diagnostic Laboratory Hub: A New Health Care System Reveals the Incidence and Mortality of Tuberculosis, Histoplasmosis, and Cryptococcosis of PWH in Guatemala. Open Forum Infect Dis. 2019 Dec

Samayoa B, Aguirre L, Bonilla O, Medina N, Lau-Bonilla D, Mercado D, Moller A, Perez JC, Alastruey-Izquierdo A, Arathoon E, Denning DW, Rodríguez-Tudela JL; “Fungired”. The Diagnostic Laboratory Hub: A New Health Care System Reveals the Incidence and Mortality of Tuberculosis, Histoplasmosis, and Cryptococcosis of PWH in Guatemala. Open Forum Infect Dis. 2019 Dec 15;7(1):ofz534. doi: 10.1093/ofid/ofz534. PMID: 31915715.

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Fungired. Comparative performance of the laboratory assays used by a Diagnostic Laboratory Hub for opportunistic infections in people living with HIV. AIDS. 2020 Sep 1

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Ana Alastruey-Izquierdo*, Emilia Mellado, Teresa Pelaez, Javier Pemán, Soledad Zapico, María Álvarez, Juan L Rodriguez-Tudela, Manuel Cuenca-Estrella Population-Based Program of filamentous fungi and Antifungal Resistance in Spain (FILPOP STUDY). Antimicrob Agents Chemother. 2013 Jul;57(7):3380-7. doi: 10.1128/AAC.01287-13. PMID: 28319466

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The global problem of antifungal resistance: prevalence, mechanisms, and management. Lancet Infect Dis. 2017 Dec

Perlin DS, Rautemaa-Richardson R, Alastruey-Izquierdo A. The global problem of antifungal resistance: prevalence, mechanisms, and management. Lancet Infect Dis. 2017 Dec;17(12. doi: 10.1016/S1473-3099(17)30316-X. PMID: 28774698.

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Project from GEMICOMED (SEIMC) and REIPI. Molecular identification and susceptibility testing of molds isolated in a Prospective Surveillance of Triazole Resistance in Spain (FILPOP2 study). Antimicrob Agents Chemother. 2018 Jun

Alastruey-Izquierdo A*, Alcazar-Fuoli L, Rivero-Menéndez O, Ayats J, Castro C, García-Rodríguez J, Goterris-Bonet L, Ibáñez-Martínez E, Linares-Sicilia MJ, Martin-Gomez MT, Martín-Mazuelos E, Pelaez T, Peman J, Rezusta A, Rojo S, Tejero R, Vicente Anza D, Viñuelas J, Zapico MS, Cuenca-Estrella M; members of the FILPOP2 Project from GEMICOMED (SEIMC) and REIPI. Molecular identification and susceptibility testing of molds isolated in a Prospective Surveillance of Triazole Resistance in Spain (FILPOP2 study). Antimicrob Agents Chemother. 2018 Jun 25. doi: 10.1128/AAC.00358-18. PMID: 29941643.

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In vitro activity of APX001A against rare moulds using EUCAST and CLSI methodologies. J Antimicrob Chemother. 2019 May 1

Rivero-Menendez O, Cuenca-Estrella M, Alastruey-Izquierdo A.* In vitro activity of APX001A against rare moulds using EUCAST and CLSI methodologies. J Antimicrob Chemother. 2019 May 1;74(5):1295-1299. doi: 10.1093/jac/dkz022. PMID: 30753499.

PUBMED DOI

In vitro activity of olorofim (F901318) against clinical isolates of cryptic species of Aspergillus by EUCAST and CLSI methodologies. J Antimicrob Chemother. 2019 Jun 1

Rivero-Menendez O, Cuenca-Estrella M, Alastruey-Izquierdo A.* In vitro activity of olorofim (F901318) against clinical isolates of cryptic species of Aspergillus by EUCAST and CLSI methodologies. J Antimicrob Chemother. 2019 Jun 1;74(6):1586-1590. doi: 10.1093/jac/dkz078. PMID: 30891600.

PUBMED DOI

Molecular Identification, Antifungal Susceptibility Testing, and Mechanisms of Azole Resistance in Aspergillus Species Received within a Surveillance Program on Antifungal Resistance in Spain. Antimicrob Agents Chemother. 2019 Aug 23

Rivero-Menendez O, Soto-Debran JC, Medina N, Lucio J, Mellado E, Alastruey-Izquierdo A*. Molecular Identification, Antifungal Susceptibility Testing, and Mechanisms of Azole Resistance in Aspergillus Species Received within a Surveillance Program on Antifungal Resistance in Spain. Antimicrob Agents Chemother. 2019 Aug 23;63(9). doi: 10.1128/AAC.00865-19. PMID: 31285229.

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Clinical and Laboratory Development of Echinocandin Resistance in Candida glabrata: Molecular Characterization. Front Microbiol. 2019 Jul 11

Rivero-Menendez O, Navarro-Rodriguez P, Bernal-Martinez L, Martin-Cano G, Lopez-Perez L, Sanchez-Romero I, Perez-Ayala A, Capilla J, Zaragoza O, Alastruey-Izquierdo A*. Clinical and Laboratory Development of Echinocandin Resistance in Candida glabrata: Molecular Characterization. Front Microbiol. 2019 Jul 11;10:1585. doi: 10.3389/fmicb.2019.01585. PMID: 31354675.

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In vitro activity of olorofim against clinical isolates of Scedosporium species and Lomentospora prolificans using EUCAST and CLSI methodologies. J Antimicrob Chemother. 2020 Aug 28

Rivero-Menendez O, Cuenca-Estrella M, Alastruey-Izquierdo A.* In vitro activity of olorofim against clinical isolates of Scedosporium species and Lomentospora prolificans using EUCAST and CLSI methodologies. J Antimicrob Chemother. 2020 Aug 28. doi: 10.1093/jac/dkaa351. PMID:32856079.

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High SARS-CoV-2 viral load and low CCL5 expression levels in the upper respiratory tract are associated with COVID-19 severity.

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Neighborhood environmental factors linked to hospitalizations of older people for viral lower respiratory tract infections in Spain: a case-crossover study.

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Diagnostic Performance of the HCV Core Antigen Test To Identify Hepatitis C in HIV-Infected Patients: a Systematic Review and Meta-Analysis.

Sepúlveda-Crespo D, Treviño-Nakoura A, Bellon JM, Jiménez-Sousa MA, Ryan P, Martínez I#, Fernández-Rodríguez A#, Resino S#. Diagnostic Performance of the HCV Core Antigen Test To Identify Hepatitis C in HIV-Infected Patients: a Systematic Review and Meta-Analysis. J Clin Microbiol. 2023 Jan 26; 61(1):e0133122. doi: 10.1128/jcm.01331-22. PMID: 36537787.

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HCV Cure With Direct-Acting Antivirals Improves Liver and Immunological Markers in HIV/HCV-Coinfected Patients.

Brochado-Kith Ó, Martínez I*, Berenguer J, González-García J, Salgüero S, Sepúlveda-Crespo D, Díez C, Hontañón V, Ibañez-Samaniego L, Pérez-Latorre L, Fernández-Rodríguez A, Ángeles Jiménez-Sousa M, Resino S*. HCV Cure With Direct-Acting Antivirals Improves Liver and Immunological Markers in HIV/HCV-Coinfected Patients. Front Immunol. 2021 Aug 23;12:723196. doi: 10.3389/fimmu.2021.723196. eCollection 2021.PMID: 34497613 (A; FI= 8.786; Q1 Immunology; JCR 2021).​

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