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DTO. de Epidemiología de enfermedades crónicas
Unidad de Bioinformática y Gestión de Datos
Unidad de Envejecimiento, Neurodegeneración y Salud Mental
Personal plantilla
- Pablo Fernández Navarro (Jefe de Unidad)
- Celia Talaván González
Personal contratado
- Javier González Palacios
Contacto
Información general
La Unidad de Bioinformática y Gestión de Datos (Bioinformatics and Data Management; BIODAMA) del Centro Nacional de Epidemiología (CNE-ISCIII), proporciona apoyo técnico y metodológico en bioinformática, análisis de datos, diseño de bases de datos y desarrollo de herramientas digitales aplicadas a la investigación epidemiológica y la salud pública.
La Unidad desarrolla y mantiene infraestructuras y recursos tecnológicos orientados a la gestión, integración, análisis y visualización de información epidemiológica, genética y ambiental, dando soporte a proyectos a la investigación del CNE así como a otros grupos del ISCIII y a distintas redes nacionales e internacionales.
Asimismo, participa en el desarrollo de aplicaciones bioinformáticas, servidores interactivos de información epidemiológica y herramientas digitales para análisis espacial, epidemiología genética y medicina preventiva de precisión.
La Unidad se centra especialmente en:
- diseño y gestión de bases de datos epidemiológicas,
- integración y análisis de datos poblacionales, ambientales y genómicos,
- bioinformática aplicada a epidemiología molecular y genética,
- desarrollo de herramientas web y aplicaciones móviles,
- infraestructuras de computación, almacenamiento y transferencia de datos,
- y formación científico-técnica en análisis de datos y programación estadística.
Áreas funcionales
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Área de diseño y desarrollo de instrumentos para la obtención y transmisión de información: obtención automatizada de datos de fuentes oficiales mediante programación, creación de interfaces digitales para encuestas epidemiológicas y desarrollo de aplicaciones web y para dispositivos móviles.
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Área de análisis e integración de datos epidemiológicos: asesoramiento en diseño y análisis epidemiológico-estadístico, integración, depuración y documentación de fuentes de datos poblacionales, ambientales y genómicas.
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Área de bioinformática: desarrollo y aplicación de herramientas bioinformáticas en el contexto de la investigación epidemiológica molecular y genética.
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Área de infraestructuras de computación, almacenamiento y transferencia de datos: desarrollo y mantenimiento de tecnologías de la información que faciliten el acceso compartido, análisis, almacenamiento y transferencia segura de datos científicos y epidemiológicos.
Servicios
Diseño y desarrollo de herramientas digitales
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Desarrollo de aplicaciones web y aplicaciones para dispositivos móviles orientadas a investigación epidemiológica y salud pública.
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Desarrollo de interfaces digitales para cuestionarios y recogida de información epidemiológica.
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Automatización de procesos de obtención y actualización de datos mediante programación y scripting.
Gestión e integración de datos epidemiológicos
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Diseño, gestión y documentación de bases de datos epidemiológicas.
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Integración, depuración y armonización de fuentes de información poblacionales, ambientales y genómicas.
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Desarrollo de procedimientos de integración y análisis reproducible de datos epidemiológicos.
Bioinformática y análisis genómico
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Desarrollo de aplicaciones de anotación genética para SNPs, microRNAs y otros marcadores moleculares.
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Integración, representación y análisis de datos genómicos.
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Herramientas de interoperabilidad y recodificación de identificadores genéticos y bases de datos ómicas.
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Soporte bioinformático a proyectos de epidemiología genética y medicina preventiva de precisión.
Sistemas y plataformas de información epidemiológica
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Desarrollo, actualización y mantenimiento de plataformas interactivas del CNE-ISCIII:
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ARIADNA: https://ariadna.isciii.es/
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RAZIEL: https://raziel.isciii.es/
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Desarrollo de herramientas de análisis espacial y vigilancia epidemiológica como RANKSPA, GEO-CIBER y AMICAES.
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Desarrollo de software y herramientas reproducibles disponibles parcialmente en GitHub: https://github.com/biodama
Formación y apoyo científico-técnico
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Formación en programación estadística y análisis y visualización de datos con R.
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Formación en desarrollos web, informes automáticos y apoyo metodológico en epidemiología, bioestadística y bioinformática.
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Soporte técnico y logístico a proyectos de investigación en salud pública.